۲۴ آبان ۱۴۰۴
به روز شده در: ۲۴ آبان ۱۴۰۴ - ۱۸:۰۳
فیلم بیشتر »»
کد خبر ۱۰۲۰۰۷۲
تاریخ انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳
کد ۱۰۲۰۰۷۲
انتشار: ۰۹:۱۸ - ۱۹-۰۹-۱۴۰۳

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق

پیش‌بینی داروهای تأثیرگذار مبتنی بر یادگیری عمیق
یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

«پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب با دخالت اطلاعات شباهت ترکیبات دارویی و دنباله‌های پروتئینی در شبکه‌های مبتنی بر یادگیری عمیق» عنوان طرح پسادکتری کریم عباسی و گرنت پژوهشی حمیدرضا ربیعی است که بنیاد ملی علم ایران از این طرح حمایت کرده است.

به گزارش ایسنا، کریم عباسی با مدرک دکتری تخصصی بیوانفورماتیک از دانشگاه تهران درباره این طرح توضیح داد: یکی از مهم‏ترین هدف‌های فازهای اولیه کشف دارو، یافتن مولکول‌های دارویی کاندیدا با فعالیت فارماکولوژیک مناسب و سمیت کم است. روش‏‌های آزمایشگاهی طراحی و کشف دارو زمان‏بر و پرهزینه هستند.

وی ادامه داد: بنابراین در کنار روش‏‌های آزمایشگاهی، از روش‌های محاسباتی نیز استفاده می‌‏شود. از روش‌های محاسباتی که برای پیش‌بینی بهترین کاندیدای داروها استفاده می‌‏شود، می‌‏توان به روش‌های سیستم بیولوژی، یادگیری ماشین کلاسیک و یادگیری عمیق اشاره کرد. با استفاده از این روش‏‌ها می‌توان داروهای تأثیرگذار را پیش‌بینی کرد و سپس تحقیقات آزمایشگاهی بر روی آنها انجام شود.

این پژوهشگر در ادامه بیان کرد: در این پژوهش پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب (CPI) مورد بررسی قرار گرفت. در پیش‌بینی تعامل پروتئین-ترکیب مقدار عددی تمایل اتصال یک ترکیب (کاندیدای دارو) با یک پروتئین هدف تعیین می‌شود که نقش اساسی در فاز اولیه پروسه‌ کشف دارو دارد.

وی ادامه داد: همچنین در این تحقیق به دنبال پاسخ به این سؤال اساسی بودیم که آیا می‌‏توان مدلی مبتنی بر یادگیری عمیق که بتواند با بهره‌‏گیری از دانش اضافی موجود در مجموعه داده‌ها، همانند اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها طراحی کرد؟

عباسی در پایان خاطر نشان کرد: یک مدل محاسباتی مبتنی بر یادگیری عمیق برای پیش‌بینی میزان تعامل جفت پروتئین-ترکیب با در نظر گرفتن اطلاعات شباهت میان ترکیبات دارویی و پروتئین‌ها نیز طراحی شد. از این مدل بیشتر در فازهای اولیه طراحی دارو استفاده خواهد شد.

برچسب ها: دارو ، یادگیری عمیق
ارسال به دوستان
ورود کد امنیتی
captcha
مدیرروستا: اگر با روش کیپ‌ورد در جام جهانی بازی کنیم، دنبال گل نخوردن خواهیم بود کیلیان ام‌باپه تاریخ‌ساز شد؛ ۴۰۰ گل حرفه‌ای در ۲۶ سالگی فینالیست کریمی، حذف تلخ نصیراحمدی؛ نتایج ملی‌پوشان تکواندو در ریاض دبیر کمیسیون اصل ۹۰: انحلال بانک سابق آینده تصمیمی شایسته بود اعلام روش نهایی چگونگی پرداخت «کالابرگ» ظرف هفته جاری گزینه اول هیئت مدیره استقلال برای مدیرعاملی مشخص شد قیمت سکه پارسیان امروز شنبه ۲۴ آبان ۱۴۰۴ بحران آب در تهران؛ هر شب ۸۱۰ میلیارد تومان از جیب مردم می‌رود دربی ۱۰۶ در اراک منتفی شد؟ شیراز جدی‌ترین گزینه میزبانی پرسپولیس یک وبسایت: آمریکا یک بمب هسته‌ای بدون کلاهک آزمایش کرده وعده جدید استقلال خوزستان برای پرداخت مطالبات؛ اعتصاب پایان می‌یابد؟ حبوبات هم از کنترل خارج شد؛ لوبیا قرمز به کیلویی ۲۴۵ هزار تومان رسید! هشدار ایران نسبت به پیامدهای تحرکات نظامی آمریکا در منطقه کارائیب چند واقعیت جالب درباره فریدریش نیچه/ او می خواست کشیش شود اسرائیل یک «طرح اضطراری» برای غزه آماده می‌کند